采用基于高分辨率熔解曲线技术的SNP标记定位徐州142无絮的短绒控制基因

摘要：

[目的]定位徐州142无絮(XZ142w)突变体的短绒控制基因n2.[方法]以陆地棉(Gossypium hirsutum L)徐州142(XZ 142)×XZ142w的F2群体为研究对象,利用108个简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)标记对n2进行初步定位,再根据2个亲本材料中有单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphic,SNP)的差异基因设计50对SNP引物,用高分辨率熔解曲线(High resolution melting,HR M)技术从中筛选在亲本间有多态性的SNP引物,并用于后代的基因分型.[结果]利用108个SSR标记将n2初步定位在26号染色体的20.2cM的遗传区间内;用HRM技术筛选到9对亲本间有多态性的SNP引物,成功实现基因分型;并结合以SSR构建的连锁图谱,将n2的遗传区间缩小为19.5 cM,n2与最近的SNP标记Cricaas20158遗传距离为5.5 cM,且遗传图谱上的标记与四倍体陆地棉测序物理图谱基本一致.[结论]HRM技术可用于棉花中的SNP检测和n2基因的定位.

关键词：陆地棉、高分辨率熔解曲线、单核苷酸多态性、简单重复序列、棉纤维、基因定位

所属期刊栏目：29

分类号：S562.03(经济作物)

资助基金：国家863计划2013AA102601-01-14;国家科技支撑计划2014BAD03B01

在线出版日期：2017-03-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1-8