陆地棉水通道蛋白GhNIP6.1基因的克隆及表达分析

摘要：

根据EST拼接的序列设计引物,利用RT-PCR技术,从陆地棉品种苏棉18中克隆获得了一个水通道蛋白基因GhNIP6.1.该基因开放阅读框包含903个核苷酸,编码300个氨基酸,分子量为30.97 kD,理论等电点为8.99.GhNIP6.1蛋白的生物信息学分析表明:GhNIP6.1含有6个跨膜区,由5个环相连,其中环A、C和E在细胞膜外,环B、D和蛋白的N、C末端都位于细胞膜内,N末端79个氨基酸,C末端18个氨基酸,具有MIP家族典型的保守氨基酸序列；该蛋白的三级结构同拟南芥的AtNIP6.1非常相似,亚细胞定位也同AtNIP6.1一致,可能位于质膜中.进化分析发现,GhNIP6.1蛋白同拟南芥的AtNIP6.1蛋白相似性最高.进一步扩增棉花核基因组获得了2021bp的DNA序列,它包含5个外显子和4个内含子,所有外显子/内含子交接点都遵从gt/ag剪接规则.半定量分析表明,该基因在根、茎和叶中都有表达,其中真叶含量较高,子叶中没有表达.

关键词：陆地棉、水通道蛋白、GhNIP6.1、表达序列标签

所属期刊栏目：25

分类号：S562.035.3(经济作物)

资助基金：国家转基因重大专项2011ZX08005-001;国家自然科学基金31101452;江苏省农业科学院博士后科研资助计划012066511108;江苏省自然科学基金BK2010465

在线出版日期：2013-03-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1-8