栽培四倍体棉种及其二倍体祖先种的Histone3 基因片段序列分析

摘要：

组蛋白是植物基因组的重要组成部分.根据Genebank中登录的Histone3基因的全长cDNA序列,设计PCR引物,进行了异源四倍体栽培陆地棉、海岛棉及其二倍体祖先种非洲棉和雷蒙德氏棉中Histone3基因片段序列分析.不同物种中获得的基因片段分别由2个内含子、部分外显子区和3'端非翻译区组成.共存在77个单核苷酸多态性位点,其中外显子区9个,内含子I区22个,内含子Ⅱ区21个,3'端非翻译区25个.外显子的SNP变化不影响Histone3基因的转录和翻译.分子聚类结果表明,不同物种A、D基因组的序列定向进化同源性明显,其中A vs D序列相似性为91. 6%,A vs ATB序列相似性为95.8%,A vs ATH序列相似性为95.2%,D vsDTB序列相似性为98.5%,D vs DTH序列相似性为98.0%.A、D染色体组基因序列部分同源性分析表明,陆地棉中ATHvs DTH序列相似性为91,0%,海岛棉中ATB vs DTB序列相似性为92.5%.聚类结果再现了A、D基因组多倍体化后其基因序列与二倍体祖先种平行演化的特点以及A、D染色体组间进化速率在四倍体棉种中与二倍体祖先种中表现的一致性.本文也讨论了基因序列在不同物种中的相似性比较不仅是研究进化的有效方法,也可用于发现基因在不同物种中SNP序列及应用前景.

关键词：棉花、物种、Histone3基因、序列分析

所属期刊栏目：16

分类号：S562.032(经济作物)

资助基金：国家自然科学基金39800089

在线出版日期：2005-10-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：195-201