无瓣海桑根响应盐胁迫的转录组分析
[目的]初步探究无瓣海桑的耐盐分子机制,筛选出无瓣海桑抗盐候选基因,为后续功能验证实验及林木抗盐性遗传育种奠定分子基础.[方法]以1年生无瓣海桑幼苗为材料,用500 mmol·L?1 NaCl分别处理0 d(对照组)和10 d(处理组),取不同条件下的根部组织进行转录组测序,并结合三代全长转录组数据进行后续生物信息学分析.[结果](1)与对照组相比,NaCl处理10 d后,无瓣海桑幼苗根系中共有14401个差异表达基因,其中,7153个上调,7248个下调.(2)GO分析发现,共有11068个差异基因在47个GO条目得到注释.(3)在KEGG富集分析中,共有6189个差异基因富集到134条通路,其中,共有14条通路显著富集(P值<0.01,Q值<0.05).(4)通过进一步对差异基因进行功能注释分析,共筛选出抗盐候选基因89个,其中,抗氧化基因24个,渗透调节物质基因22个,植物激素基因19个,蛋白激酶基因10个,转录因子基因14个.[结论]活性氧清除、渗透调节、植物激素、蛋白激酶及转录因子相关基因参与调控无瓣海桑盐逆境适应过程.
无瓣海桑、盐胁迫、转录组、差异表达基因
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S728.5(造林学、林木育种及造林技术)
国家自然科学基金;湛江市科技发展专项资金竞争性分配项目;广东海洋大学科研启动费资助项目
2023-03-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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