麻竹笋转录组测序及苦涩味物质合成基因差异表达分析

摘要：

[目的]研究避光处理对麻竹笋苦涩味物质合成相关基因表达的影响.[方法]利用Illumina HiSeq TM 2500平台对自然生长(CK)和覆土处理(EP)2种类型的麻竹笋进行转录组测序,并对差异表达基因进行分析.[结果]转录组测序共获得36.45 Gb原始数据,经组装去冗余处理得到53388个Unigene,将所得Unigene比对到Nr、Pfam、COG、Swissprot、GO和KEGG数据库中进行功能注释,发现共有31462条Unigene与其它物种的基因具有同源性.对CK和EP处理所测得的Unigene进行表达量的比较分析,筛选出1846个差异基因,其中,在EP处理中上调表达基因998个,下调表达基因848个.由KEGG代谢通路分析发现,差异基因显著地富集在32个代谢途径中,其中,包含与苦涩味物质合成相关的糖酵解途径、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸合成途径等.进一步研究发现,参与麻竹笋芳香族氨基酸、单宁合成的PFK、ENO、PPY-AT/HPP-AT、LAR等酶基因在EP处理中表达量下降,荧光定量PCR验证结果与测序结果基本一致.[结论]避光处理抑制了苯丙氨酸、酪氨酸、单宁生物合成关键酶基因的表达,可能最终影响麻竹笋苦涩味物质的合成.

关键词：麻竹笋、避光、转录组测序、苦涩味物质、差异表达基因

所属期刊栏目：31

分类号：S718.46;S795.5(林业基础科学)

资助基金：科技部对发展中国家科技援助项目"中国向巴西提供竹子培育与高效利用技术"KY201502001

在线出版日期：2018-09-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：38-46