中间锦鸡儿CiDR1的克隆及干旱胁迫下的表达分析

摘要：

[目的]研究并了解中间锦鸡儿CiDR1基因功能及其对干旱胁迫的响应,为抗性育种提供候选基因.[方法]通过RACE技术从中间锦鸡儿中克隆CiDR1基因的cDNA全长,利用生物信息学分析软件对其基因结构及功能进行分析和预测.再通过qRT-PCR技术对干旱胁迫后的幼苗中的CiDR1表达模式进行研究.[结果]从中间锦鸡儿中克隆到CiDR1基因的cDNA全长共计4 297 bp,GenBank登录号为KP277100.生物信息学分析表明,预测的Ci-DR1蛋白序列中含有1 243个氨基酸残基,具有抗病基因特征结构域TIR、NB-ARC、LRR等,其等电点为6.35,不稳定指数为42.91,不具备信号肽,为非分泌蛋白,定位于细胞质中.定量PCR检测发现,CiDR1基因在幼年期的茎中表达量较低,在成年期的叶片中表达量较高;在干旱胁迫处理后的幼苗中,CiDR1表达水平有明显下降,表明该基因的表达受干旱抑制,可能与中间锦鸡儿适应干旱相关.[结论]中间锦鸡儿在干旱胁迫后其根、茎和叶中CiDR1的表达均明显下降,表明CiDR1的表达受干旱抑制,可能与中间锦鸡儿适应干旱相关,进一步研究发现CiDR1在根、茎、叶中的表达水平可能受发育阶段调控.

关键词：中间锦鸡儿、CiDR1、TIR-NBS-LRR、干旱

所属期刊栏目：30

分类号：S718.46(林业基础科学)

资助基金：国家高技术研究发展计划863项目2013AA102704;国家自然科学基金31330017

在线出版日期：2017-09-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：238-244