寡核苷酸管芯片技术检测和鉴别我国不同组植原体

摘要：

[目的]不同组植原体检测和鉴别的特异性探针已有报道，为了筛选出适合于我国不同组植原体检测和鉴别的特异性探针，建立管芯片检测和鉴别植原体技术，并对我国发生的疑似植原体病害进行鉴别。[方法]通过 PCR扩增结合管芯片杂交技术，对收集到的15种植原体侵染的植物样品及其健康对照进行检测和鉴别。[结果]建立了管芯片检测和鉴别植原体技术体系。15种病害样品中，13种获得显著的阳性杂交信号，并且所有的健康对照都呈现为阴性。13种植原体病害依16Sr DNA 直接测序可分为16Sr Ⅰ、Ⅱ、Ⅴ、XIX 四组植原体。在所有探针中，植原体的通用探针（Pp-502）可以检测到所有确定的植原体样品。16SrⅠ组特异性探针（PpⅠ-465）可以确定16SrⅠ组的泡桐丛枝、苦楝丛枝、桑树萎缩和莴苣黄化4种植原体样品。16SrII 组特异性探针（PpⅡ-629）仅可以确定16Sr II 组的花生丛枝、甘薯丛枝和臭矢菜丛枝3种植原体样品。但16SrV 组的枣疯病、樱桃致死黄化和重阳木丛枝及16Sr XIX 组的板栗黄化皱缩植原体与其他组专化性探针皆有明显的交叉杂交信号。相比于 PCR 扩增的凝胶电泳检测，管芯片检测的灵敏度提高了1000倍。对疑似植原体病害的诊断结果显示河南濮阳的红花槐丛枝的病原应为16SrV 组植原体，福建福州的长春花黄化丛枝应为16SrⅠ组植原体；而北京戒台寺牡丹黄化皱叶和内蒙古包头柳树丛枝未出现任何植原体专化的杂交信号。[结论]管芯片杂交技术作为一种检测和鉴别植原体的方法，可应用于我国植原体病害调查和诊断，并为植原体的鉴别和分类提供可靠的依据。

关键词：管芯片、植原体、病害鉴定与诊断、16Sr DNA 基因

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分类号：S763.1(森林保护学)

资助基金：“十二五”农村领域国家高技术研究发展科技计划863课题2012AA101501;林业微生物资源子平台运行与服务项目NIMR2016－7。

在线出版日期：2017-03-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：99-110