红椿 SSR-PCR 体系建立和多态性引物筛选

摘要：

[目的]本研究旨在建立红椿 SSR-PCR 最佳反应体系，并筛选适于红椿 SSR 分析的高多态性引物。[方法]通过 L16（45）正交试验设计，确立红椿 SSR-PCR 最佳反应体系；利用优化后的体系对来自楝科植物的135对 SSR 引物，在6个不同的红椿居群中进行扩增，筛出能有效扩增的引物并进一步筛选出适于红椿的高多态性引物。[结果]（1）10μL 基于荧光 dUTP 的 SSR-PCR 体系中包含：10×buffer 1．0μL，Taq 酶（5 U·μL －1）0．1μL，MgCl2（25 mmol·L －1）0．8μL，dNTP （200 mmol·L －1）0．025μL，荧光 dUTP（1 nmol·μL －1）0．01μL，引物（10 mmol·L －1） 0．8μL，DNA 模板45 ng 剩余用 ddH2 O 补足；（2）筛选出29对能有效扩增的引物，复选后获得了12对适于红椿 SSR分析的高多态性引物。[结论]建立了 SSR-PCR 最佳反应体系并筛选出高多态性引物，为红椿的分子标记等遗传学研究提供了基础。

关键词：SSR、红椿、体系优化、引物筛选

所属期刊栏目：29

分类号：S792.99(森林树种)

资助基金：国家林业局公益性行业专项201004020。

在线出版日期：2016-08-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：565-570