10.3969/j.issn.1001-1498.2016.04.008
毛竹 TIPs 基因家族成员组织表达模式研究
[目的]通过研究毛竹 TIPs 的分子特征和表达模式,为揭示逆境胁迫条件下 TIPs 在竹子中的作用提供证据,为培育抗逆的植物新品种提供新的基因资源。[方法]以毛竹为对象,利用生物信息学方法对毛竹基因组中的 TIPs基因进行了全面分析,采用实时荧光定量 PCR 技术分析基因在不同组织及干旱、水淹和 NaCl 胁迫下的表达模式。[结果]毛竹基因组中含有6个 TIPs 同源基因,分别隶属于3个亚类(TIP1、TIP2和 TIP4)。基因结构预测显示, PeTIP1;1、PeTIP1;2、PeTIP2;2和 PeTIP4;2由2个外显子和1个内含子组成,而 PeTIP2;1和 PeTIP4;1由3个外显子和2个内含子组成。蛋白结构分析显示,毛竹6个 TIPs 均具有2个典型的 NPA 结构域和4个 ar/R 模体。通过转录组数据分析基因的组织表达特异性,结果表明 PeTIP1;1在各组织中的表达丰度均较高;PeTIP1;2主要在花中表达;PeTIP2;1在根和鞭中表达量较高;PeTIP2;2在根中特异表达;PeTIP4;1在叶片中表达丰度最高;PeTIP4;2在笋和鞭中表达水平较高,在根中最低。实时定量 PCR 结果分析证明,干旱处理后毛竹根中 PeTIP4;1的表达量显著升高(p <0.01),PeTIP2;1、PeTIP2;2和 PeTIP4;2表达受到抑制(p <0.01);水淹处理后根中 PeTIP1;1和 PeTIP4;1表达量显著增加(p <0.01),PeTIP1;2、PeTIP2;2、和 PeTIP4;2则显著降低(p <0.01);NaCl 处理后根中6个 PeTIPs的表达量均显著增加(p <0.01)。干旱处理后毛竹叶片中 PeTIP1;1、PeTIP1;2和 PeTIP4;1表达量均显著增加(p <0.01);水淹处理后叶片中 PeTIPs 表达量均显著提高(p <0.01);NaCl 处理后叶片中 PeTIP2;1表达受到明显抑制(p<0.01)。[结论]PeTIPs 可能在毛竹抵抗干旱、水淹和 NaCl 等非生物胁迫中发挥着不同程度的作用。
毛竹、液泡膜内在水通道蛋白、表达分析
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S795.7(森林树种)
国家科技支撑计划课题“竹藤优异种质创制创新与种苗培育标准化示范”2015BAD04B01;国际竹藤中心基本科研业务费专项资金项目1632015008。
2016-08-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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