油桐尺蛾核型多角体病毒广西株全基因组序列

摘要：

油桐尺蛾核型多角体病毒广西株基因组序列由Sanger测序的方法得到.拼接后获得了121 268 bp序列,GC含量为36.76％.以长度不小于50 aa的序列认定为功能基因,共预测到131个开放阅读框,通过Blast比对,其中87个能注释到功能基因.对基因组序列进重复序列分析,共发现SSR位点174个,同源重复序列1个.在SSR位点中,包含6种长度的重复基序,且以富含AT的重复基序为主.同源重复序列两端为-59 bp片段或其一部分组成的重复序列,两端分别重复12次和7次,中间则为一段与重复片段无关的236 bp片段.与武汉株相比,广西株病毒在37个核心基因中有4个存在蛋白序列长度上的差异,而在其他非核心基因中有6个基因仅存在于一个病毒株中,另有13个基因存在蛋白序列长度上的差异.

关键词：油桐尺蛾、核型多角体病毒、株系、基因组、重复序列

所属期刊栏目：28

分类号：S763.3(森林保护学)

资助基金：国家自然科学基金项目31400549;中国博士后科学基金资助项目2014M552533XB;广西博士后专项资助项目;广西林科院基金项目林科201401号

在线出版日期：2015-11-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：612-617