10.11707/j.1001-7488.LYKX20220787
基于SSR标记的山茶属位点组合品种鉴别能力分析评价
[目的]筛选多态性高、通用性强等的SSR位点,评估筛选所得SSR位点的组合在山茶属品种中的鉴别能力;在保持最大鉴别能力的基础上,确定可用于山茶属品种鉴别所需的最少SSR位点的组合,提高品种鉴别效率.[方法]本研究以 111份山茶属品种为材料,结合凝胶电泳、荧光毛细管电泳、位点多态性分析和位点组合品种鉴别力(VDP)分析等方法,筛选评价SSR位点并对SSR位点组合的品种鉴别力进行分析与评价.[结果]本研究筛选获得17个SSR位点,占筛选位点总数的 30.9%,在 111份山茶属品种中,共检测到 166个等位基因,单位点基因型数量范围为 6～35,均值为 23.353个,观测等位基因数(Na)范围为 3～15,均值为 9.765个,多态性信息含量(PIC)的范围为0.447～0.835,均值为 0.696,位点缺失率的范围为 0～4.50%,均值为 0.90%.当差异位点数=1时,17个SSR位点在全部品种(系)、红山茶组品种和金花茶组无性系中达到的R-VDP最大值均为1,可将SSR位点数量分别缩减到11、10、5个,分别占筛选所得位点数的 64.7%,58.8%和 29.4%;当差异位点数=2时,17个SSR位点在全部品种(系)、红山茶组品种和金花茶组无性系中达到的R-VDP最大值分别为 0.964,0.952和 1.000,可将SSR位点数量分别缩减到 12、12、和 7个,分别占筛选所得位点数的 70.6%、70.6%和 41.2%;当差异位点数=3时,17个SSR位点在全部品种(系)、红山茶组品种和金花茶组无性系中达到的R-VDP最大值分别为 0.946,0.929,1.000,可将SSR位点数量分别缩减到 8、7和 8个,分别占筛选所得位点数的 47.1%、41.2%和 47.1%.当差异位点数≤6时,17个SSR位点组合对山茶属测试品种(系)群的R-VDP最大值可保持相对稳定的水平.[结论]本研究筛选验证获得 17个多态性高、通用性强等的SSR位点;这些位点的组合在山茶属品种(系)群中均表现出良好的品种鉴别能力;确定了山茶属不同类群品种(系)鉴别所需的最少SSR位点的组合,构建了一套山茶属SSR位点组合品种鉴别能力分析评价的体系,为山茶属品种鉴别及相关标准的制定等奠定了基础.
山茶属、SSR标记、位点组合、品种鉴别能力、VDPtools
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Q958.15;S154.5(动物学)
国家林业与草原种质资源库2005DKA21003
2023-10-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共11页
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