不同生态环境下银中杨内生菌群落结构及生态位变异
[目的]研究生长在3个不同地点的银中杨根和茎中内生细菌和真菌的多样性,为植物和微生物互作研究提供参考.[方法]分别在黑龙江省大庆市林源镇常围子村、齐齐哈尔市错海林场和北京市房山区韩村河东营苗圃,取银中杨根和茎,表而消毒后,提取微生物DNA,通过16S rRNA和内部转录间隔区(ITS)扩增子IlluminaMiSeq测序以确定内生细菌和真菌群落的多样性.[结果]测序结果根据97％的序列相似性水平,将细菌和真菌的reads分别归类为1 541和240个OTU.与数据库比对后确定银中杨内生细菌群落主要以放线菌纲、3-变形菌纲、α-变形菌纲、γ-变形菌纲和拟杆菌纲为主,内生真菌群落主要以座囊菌纲、伞菌纲、子囊菌纲、和银耳纲为主.α多样性和B多样性结果表明,北京、大庆和齐齐哈尔3个地点银中杨的茎内生菌群落明显聚集;而根内生菌群落表现出依赖于植物器官和生长环境的现象.Mantel检验结果表明,pH值、土壤有机质(SOM)含量和钾(K)含量与杨树根内生菌群落显著相关(P＜0.05);而氮(N)、磷(P)含量并不是解释银中杨根内生菌群落差异的重要因素.由此确定不同生态环境下生长的银中杨不同器官中的核心微生物,共获得23个核心细菌OTU,归属于6个纲;22个核心真菌OTU,归属于7个纲.还可确定7个根内生细菌指示OTU:Actinophytocola、游动放线菌属、假诺卡氏菌属、红微菌属、链霉菌属、贪噬菌属和慢生根瘤菌属;5个茎内生细菌指示OTU:双歧杆菌属、红球菌属、小杆菌属、粪杆菌属和微球菌属.2个根内生真菌指示OTU:小球腔菌属和Ilyonectria;3个茎内生真菌指示OTU:格孢腔目、链格孢属和Endosporium.UpSetR结果表明:内生细菌中有51(3.30％)个OTU被6组样本共有,6个组单独特有的OTU占总OTU数的4.54％～15.44％;内生真菌中有1(0.42％)个OTU被6组样本共有,6个组单独特有的OTU占了总OTU数的2.92％ ～29.17％.[结论]银中杨根内生细菌和真菌群落结构取决于栽植环境中土壤的pH值、有机质含量和钾含量.不同植物器官可代表内生菌群落的独特生态位.本研究可确定与银中杨不同器官和不同生长环境条件相关的指示OTU和核心微生物.
银中杨、环境条件、内生菌群落、生态位变异、扩增子测序
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S718.46(林业基础科学)
中央级公益性科研院所基本科研业务赀专项重点项目子项目“杨树工业用材新型品种选育研究”CAFYBB2017ZA001-3
2020-04-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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