基于SSR标记的木荷核心种质构建
[目的] 通过对比分析与评价以确定木荷核心种质构建的最适取样策略和比例,并构建木荷核心种质;在此基础上,进一步建立核心种质分子身份信息,为木荷种质资源的深入研究和加强利用、发掘优异基因资源提供理论依据和核心材料,同时也可为其他多年生木本植物核心种质的构建提供参考.[方法] 利用13对SSR引物,以来自7个省(市)29个地区的754份木荷种质资源为材料,利用M策略(M)、随机取样法(R)、遗传多样性最大化法(SAGD)和等位基因最大化法(SANA)分别构建核心种质.采用等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)和Shannon''s信息指数(I)等遗传多样性指标进行比较分析来确定最适合的构建方法.[结果] 13对SSR引物共检测到128个等位基因(Na),平均有效等位基因数(Ne)为3.47,Shannon''s信息指数(I)为1.39,表明木荷种质资源具有丰富的遗传多样性.SANA、SAGD和M策略构建的核心种质均优于R策略.SANA和SAGD法抽取的核心种质对原有种质均具有较好的代表性,但等位基因保留率较低.M策略构建的核心种质等位基因(Na)保留比例明显高于其他3种策略所构建的核心种质.根据遗传多样性参数综合考虑,同时考虑抽样数量,M策略构建的核心种质能以最小的取样量、最大程度地保留原有种质的遗传多样性,为最优的取样策略.采用主坐标分析法显示,M策略构建的核心种质能够较全面地代表木荷种质资源的遗传多样性,利用该策略得到的115份木荷核心种质,保留了原有种质15.3%的种质材料,等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)和Shannon''s信息指数(I)的保留率分别达到93.8%,115.6%和109.9%.依据13对SSR引物的扩增数据,经过多态性谱带的有序编码转换,构建了115份木荷核心种质的特异分子身份信息,置信概率达到99.99%,具有有效性和唯一性.[结论] M策略是较适宜的构建木荷核心种质的方法,构建的115份核心种质能最大程度代表木荷种质资源的遗传多样性,同时,本研究所采用的方法对其他多年生木本植物核心种质的构建具有重要的参考价值.
木荷、SSR标记、核心种质、分子身份信息
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S722;S718.46(造林学、林木育种及造林技术)
"十二五"国家科技支撑计划课题2012BAD01B04;浙江省竹木农业新品种选育重大科技专项竹木育种协作组项目2012C12908-6;福建省林木种苗科技攻关五期项目木荷课题;江西省林业厅林业科技创新专项项目201503
2017-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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