基于核微卫星的短柄枹栎居群遗传多样性和遗传结构
【目的】短柄枹栎作为中国南方重要的森林树种之一，近年来受人为活动影响物种退缩严重，对该物种居群的遗传多样性、遗传结构以及遗传结构与地理分布的相关性进行研究，以对短柄枹栎提出相关的保护策略。【方法】共采集到24个短柄枹栎居群共计398个个体，样本覆盖短柄枹栎现今的分布范围。采用8对变异丰富的核微卫星(nSSR)分子标记统计短柄枹栎各个居群的遗传多样性，使用分子方差分析(AMOVA)计算物种的遗传差异，并采用 STRUCTURE和 Alleles In Space软件分析物种整体的遗传结构，探讨短柄枹栎遗传结构与其地理环境的关系。【结果】短柄枹栎居群具有丰富的遗传多样性，平均期望杂合度 He =0.43，平均观测杂合度 Ho =0.28，平均等位基因数 Na =3.67，平均有效等位基因数 Ne =1.96，平均 Shannon 指数 I =0.66，多态位点百分率 PPL =82.81%；短柄枹栎的遗传差异主要存在于居群内部(FST =0.22，P ＜0.001)，不同居群的遗传多样性存在差异。基于贝叶斯的聚类分析( STRUCTURE)将短柄枹栎居群划分为东部和西部2组，居群之间存在基因交流( Nm =1.88)。东部群组和西部群组之间存在较大的遗传分化(FST =0.25，P ＜0.001)，而东、西群组内部居群之间的遗传差异则相对较小。居群景观遗传分析( AIS)显示东部与西部群组之间较大的遗传差异，这一结果与聚类分析(STRUCTURE)的结果一致；居群间遗传距离和地理距离没有显著的相关性(R2=0.011，P =0.07)。【结论】基于核 SSR标记的遗传多样性研究显示短柄枹栎具有丰富的遗传多样性，这一特性与其复杂的种群动态历史、风媒传粉的生物学特性及所处的生活环境相关，短柄枹栎东部和西部分布的居群之间存在较大的遗传分化，西部居群之间也有较大的遗传差异。短柄枹栎现今的遗传结构可能源于该物种自然生境的异质性(如：西部地区山脉较多；东部地区海拔较低，地势较为平缓；中部地区平缓的地势所产生的地理隔离)以及近期人类活动引起的生境片段化。本研究从整体水平上揭示了短柄枹栎的遗传多样性及遗传结构特征，为该物种的遗传保护提供理论依据。
短柄枹栎、nSSR、遗传分化、地理隔离、基因流
S718.46(林业基础科学)
陕西省教育厅重点实验室专项资助12JS083。
2016-03-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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