红豆杉TcLBDs基因的克隆与表达分析
【目的】LBD( LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN)转录因子在植物次生生长中具有潜在的作用。克隆红豆杉 LBD基因，研究 LBD在红豆杉剥皮后树皮再生过程中的表达状况，以揭示其调控作用。【方法】在红豆杉剥皮再生组织转录组数据库中搜索 LBD 基因，根据获得的基因序列设计引物，利用 RT-PCR 方法克隆得到2个红豆杉 TcLBDs基因的 cDNA片段，分别命名为 TcLBD1和 TcLBD6。进一步利用生物信息学工具对其进行分析，最后利用半定量 RT-PCR 对红豆杉不同组织、利用 qRT-PCR技术对其剥皮再生不同时期的 TcLBDs 的表达进行分析。【结果】TcLBD1的cDNA包含549 bp开放阅读框( ORF)，编码182个氨基酸； TcLBD6的 cDNA包含687 bp开放阅读框，编码228个氨基酸。TcLBD1和 TcLBD6编码的蛋白质分子量分别为19.97，25.13 kDa，序列分析表明二者在 N端存在着 LBD类转录因子特有的 LOB结构域，都属于第1类( Class Ⅰ) LBD；二者在核酸序列和氨基酸序列水平上分别有55.2%和57.9%的相似性，且蛋白质二级结构也具有较高的相似性。系统进化树结果显示TcLBD1与北美云杉的蛋白(ABK21479)聚为一簇，亲缘关系最近； TcLBD6与拟南芥的 AS2/LBD6聚在一起。组织表达谱分析表明 TcLBD1在茎和木质部(含形成层)中表达量明显高于根、叶片和韧皮部(含形成层)中的表达量；TcLBD6主要在根和茎中表达。2个 TcLBDs 基因在红豆杉剥皮再生不同时期再生组织间的表达模式结果显示，在其剥皮再生过程中 TcLBD1基因表达量在6天时达到最高，整体呈上调表达； TcLBD6表达水平在18天后显著上调。【结论】克隆2个红豆杉 TcLBDs基因，TcLBD1和 TcLBD6，这2个基因在红豆杉剥皮再生过程中均有响应，推测二者在红豆杉剥皮后树皮再生过程中起调控作用。
红豆杉、LBD、转录因子、生物信息学分析、基因表达
S718.46(林业基础科学)
国家自然科学基金;国家自然科学基金
2015-11-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
126-133
