基于Illumina高通量测序的泡桐转录组研究
利用新一代高通量测序技术平台Illumina Solexa对泡桐进行转录组测序和数据de novo组装,并对得到的unigene进行功能注释、分类及代谢通路分析.结果表明,N50值为2 278 bp、平均长度为1 410 bp的泡桐unigene共有188 019条,将其与NCBI的Nr和Swiss-Prot数据库比对后发现,分别有120 808条和85 880条unigene与其他物种的基因具有同源性.利用COG数据库可将有关的41 914条泡桐unigene分成25类,KEGG数据库分析发现共有43 553个unigene参与215种代谢通路.找到与木质素合成相关的泡桐unigene.
泡桐、转录组、Illumina高通量测序、从头组装
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S718.46(林业基础科学)
国家自然科学基金;高等学校博士学科点专项科研基金;河南省杰出人才计划
2013-09-11(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共7页
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