杨树ARGONAUTE基因的克隆及序列分析

摘要：

作为RNA诱导沉默复合体的核心元件,Argonaute(AGO)蛋白在植物生长发育过程中发挥着重要作用.以欧美杨和美洲黑杨不定根cDNA为模板,采用RT-PCR技术分离得到PeAG05和PdAG05基因的cDNA克隆,测序和序列分析结果表明2个目的cDNA片段均为2 809 bp,基因内部含有完整的开放阅读框,可编码907个氨基酸,预测蛋白质分子量分别为102.31 ku和102.34 ku,理论等电点(p1)分别为9.34和9.7.所推导的2个氨基酸序列之间仅有7个差异位点,含有3个保守的结构域,DUF1785、PAZ和Piwi结构域.它们与拟南芥AtAG05蛋白的相似性分别为64.8%和64.3%,故将其命名为PeAG05和PdAG05.系统进化分析发现,PeAG05和PdAG05,与拟南芥AtAG01,AtAG05和AtAG010蛋白同属一个进化分支.此外,采用实时定量PCR技术检测PeAG05基因在杨树硬枝插穗不定根发育过程中的表达模式,推测该基因参与不定根发育调控.

关键词：畅树、硬枝插穗、Argonaute蛋白、表达模式、qRT-PCR

所属期刊栏目：47

分类号：S718.46;Q943.2(林业基础科学)

资助基金：国家重点基础研究发展计划（973计划）;林业公益性行业科研专项

在线出版日期：2011-07-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：46-51