油茶种子水通道蛋白CoPIP1-1的鉴定与分析

摘要：

以构建的油茶cDNA文库为基础,采用交错延伸PCR技术,分离克隆到一个水通道蛋白基因的编码序列(coding sequence,CDS),它编码一个287aa的跨膜蛋白(GenBank蛋白质id:ACF39901).该蛋白可能由2条基因(GenBank登录号:EU850810、EU850811)编码,这2个基因具有相同的CDS和3”-UTR,但5”-UTR不同,其中之一多了2个小的插入片段.经对该蛋白的同源性比对和特征性基序分析,推测这个水通道蛋白属于质膜内在蛋白成员,定名为CoPIP1-1.通过同源建模,论证CoPIP1-1的水通道活性与通道口的(去)覆盖有关.N端与D环、B环的静电势作用导致了对通道口的(去)覆盖,并受磷酸化,质子化门控机制调控,质子化抑制通道活性,磷酸化则解除抑制.从同源建模的结果和细胞内的氧化状态推测该蛋白为组成型的低活性,这可能是油茶种子近成熟期脱水的成因之一.

关键词：油茶、水通道蛋白基因、cDNA文库、水通道活性、生物信息学、同源建模

所属期刊栏目：44

分类号：S718.46;Q943.2(林业基础科学)

资助基金：中南林业科技大学研究生创新基金2006bx01;湖南省教育厅研究生创新基金,国家”十一五”科技支撑项目2006BAD18B0204,2006BAD01A1706

在线出版日期：2009-03-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：48-56