应用分子对接技术预测氟伐他汀对胰腺癌细胞作用的关键靶点

摘要：

目的 应用生物信息学综合考察氟伐他汀对胰腺癌MiaPaCa-2和PANC-1细胞基因表达谱的影响,并采用分子对接预测关键蛋白靶点.方法 从基因芯片公共数据库中下载氟伐他汀处理胰腺癌MiaPaCa-2和PANC-1细胞的基因表达谱芯片数据,以P<0.05和|logFC|>1为标准,筛选差异表达基因互作关系.采用VennDiagram R包取交集,得到共同差异表达基因;应用clusterProfiler R包,进行GO和KEGG通路富集分析;Cytoscape软件将差异表达基因互作关系可视化并找出潜在的关键基因,采用分子对接软件Autodock Tools-1.5.6将预测得到的关键蛋白靶点与氟伐他汀进行分子对接分析,进一步研究氟伐他汀与靶蛋白的相互作用.结果 20μM氟伐他汀处理48 h后,胰腺癌细胞MiaPaCa-2和PANC-1共同差异表达基因共27个,主要涉及DNA复制、DNA错配修复与重组、染色体凝缩以及胞质分裂等作用.KEGG通路富集分析结果显示,共同差异表达基因主要与嘧啶代谢、p53信号通路和细胞周期等相关.分子对接结果显示,氟伐他汀与EXO1、MCM10、CDC45和KIF14这4个蛋白靶点之间具有较低的结合自由能,结合稳定.结论 氟伐他汀能够影响胰腺癌细胞MiaPaCa-2和PANC-1细胞基因表达谱.EXO1、MCM10、CDC45和KIF14可能是氟伐他汀治疗胰腺癌潜在的作用靶点.

关键词：氟伐他汀、胰腺癌、分子对接、基因表达、生物信息学

所属期刊栏目：25

分类号：R285.5;R735.1;R96

在线出版日期：2023-02-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1057-1063