猪PPARγΔ5组织表达及生物信息分析

摘要：

试验旨在比较分析PPARγ和PPARγΔ5在猪组织器官的表达及生物信息学特征,探讨PPARγΔ5的生物学结构与功能.试验采用实时荧光PCR检测PPARγ和PPARγΔ5 mRNA表达,分析PPARγΔ5及PPARγ蛋白生物信息特征.结果显示,PPARγΔ5 mRNA在猪组织器官的表达水平依次为皮下脂肪组织>背最长肌>肝脏>心脏,各组织PPARγΔ5的表达均极显著低于PPARγ(P<0.01),PPARγΔ5和PPARγ二者呈显著正相关(P<0.05).PPARγΔ5蛋白由210个氨基酸组成,理论等电点(PI)5.68,不稳定系数54.26,肽链大部分位于亲水区域,属于不稳定亲水酸性蛋白质.二级结构以无规则卷曲和延伸链为主,无跨膜螺旋结构和信号肽,为非分泌型蛋白,有25个潜在的磷酸化位点.PPARγΔ5蛋白的82.6%亚细胞定位于细胞核,8.7%在细胞质,有完整的N端调节域和DNA结合域(DBD),但C端配体结合域(LBD)缺失.研究表明,猪组织器官可通过选择性剪接产生PPARγΔ 5;PPARγΔ5为亲水性非分泌蛋白,稳定性差,含有丰富的磷酸化位点,具有核转录因子的特征,可能具有与PPARγ不同的生物学功能.

关键词：猪、PPARγΔ5、组织表达、生物信息

分类号：S828.9(家畜)

资助基金：国家自然科学基金;甘肃省自然科学基金;西北民族大学中央高校建设世界一流大学学科;特色发展引导专项

在线出版日期：2023-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：15-21