保山猪和杜洛克猪IGF-1基因的SNP筛选及生物信息学分析

摘要：

试验旨在探究IGF-1基因单核苷酸突变位点对保山猪和杜洛克猪生长性能的影响.试验以保山猪和杜洛克猪为研究对象,采用直接测序法对IGF-1基因的多态性进行检测,利用生物信息学软件分析编码蛋白结构.结果显示:在保山猪IGF-1基因编码蛋白的外显子上共筛选出1个SNP位点(Exon4-G189A),该突变属于同义突变,引起密码子改变,但所编码的氨基酸未改变.生物信息学分析结果显示,保山猪IGF-1基因CDS区编码164个氨基酸,分子式为C782H1265N247O239S11,相对分子质量为18303.82,理论等电点为9.89,不稳定性指数为73.25,整体表现为亲水性,不具有跨膜结构,含有信号肽序列;蛋白质二级结构只含有无规则卷曲和α-螺旋,分别占60.37％、39.63％,三级结构预测模型与保山猪IGF-1基因的蛋白结构匹配度为-1.15,具有较好的一致性.研究表明,IGF-1基因在物种进化过程中高度保守,使其编码保山猪和杜洛克猪的氨基酸序列相同,蛋白质结构和功能差异很小或不存在差异,能否作为调控保山猪瘦肉少、脂肪多、生长慢的候选基因还需进行关联性的研究.

关键词：保山猪、杜洛克猪、IGF-1、SNP、生物信息学

分类号：S828(家畜)

资助基金：云南省科技厅重点研发项目2018BB003-2

在线出版日期：2023-04-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：26-32