猪塞内卡病毒全基因组分析及系统进化树构建

摘要：

研究对目前发现的典型A型塞内卡病毒(SVA)毒株进行遗传进化分析,旨在了解该病毒的进化路线,为相关疫苗开发和疾病防控提供参考.研究从NCBI网站中选取220株SVA全基因组序列作为分析对象,使用RDP5软件剔除重组病毒,利用MEGA7和MrBayes软件将符合要求的184条全基因组序列构建进化树.结果 显示,SVA遗传进化历程以时间跨度分为3个进化支.随着时间推移,每个进化分支中的毒株数量逐渐增加,流行扩大化.研究表明,SVA的进化树体现了地域上的屏障,每个国家的SVA分离株大多聚类在一起;该病毒由美国始发,向加拿大、巴西、哥伦比亚、中国、泰国等地扩散,并有向其他国家流行的趋势.

关键词：塞内卡病毒;全基因组;遗传进化分析;发育树

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：海南省自然科学基金高层次人才项目;海南大学"金课项目

在线出版日期：2021-12-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：5-10