金草鱼Serpinc1基因克隆及其序列分析
获取金草鱼Serpinc1基因序列,研究金草鱼与草鱼Serpinc1基因的差异,并预测金草鱼Serpinc1基因序列的特征及其编码蛋白的高级结构.本研究利用RT-PCR克隆测序技术获得金草鱼Serpinc1基因序列,分析其与草鱼Serpinc1基因的差异,并通过生物信息学方法预测金草鱼Serpinc1基因序列的特征及其编码蛋白的高级结构.结果 显示,金草鱼Serpinc1基因与草鱼相比共有4个核苷酸位点发生改变(c.1091T＞A、c.1116A＞T、c.1176T＞G和c.1179C＞ T),其中仅有1个位点(c.1091T＞ A)为错义突变,导致第364位缬氨酸(Val)转变为谷氨酸(Glu).生物信息学预测结果表明,金草鱼Serpinc1基因开放阅读框长度为1 353 bp,共编码450个氨基酸,分子量为50.89 kDa,理论等电点为6.58,不稳定指数为34.55,属于不稳定蛋白;编码氨基酸包含20种标准氨基酸,其中亮氨酸最多(10.2％),而色氨酸(Trp)含量最少(1.3％);整条肽链的亲疏水平均值为-0.213,表现为亲水性;包含4个糖基化位点和37个磷酸化位点;蛋白质二、三级结构以α螺旋和无规则卷曲为主.研究结果可为深入研究金草鱼Serpinc1分子结构和功能及其发挥该功能的活性位点的验证奠定了基础,为金草鱼出血性疾病相关分子标记的筛选提供了理论基础.
金草鱼、Serpinc1基因、基因克隆、序列分析
S8917.4(养蜂、益虫饲养)
西北民族大学中央高校基本科研业务费专项资金资助项目;西北民族大学2019年本科生科研创新项目;定西市草牧产业科技研发专项经费资助2017
2020-08-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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