沈阳地区1株猪流行性腹泻病毒S1基因序列测定与分析
利用PEDV的S1基因的特异性引物,克隆了沈阳地区1株PEDV流行毒株(LNSY-2017)的S1基因,并通过S1基因序列比对,分析了此病毒株与其他相关毒株的亲缘关系.结果显示:LNSY-2017株S1基因(2372 bp)与我国疫苗株CV777(2364 bp)相比,存在16个核苷酸的插入和8个核苷酸的缺失,导致推导的氨基酸序列存在6个氨基酸的插入(56G、59QGVN62和69G)和6个氨基酸的缺失(73N、157FA158、380YL381和521G),且在2个主要中和抗体表位(aa499~637和aa763~770)有11处氨基酸的突变.遗传进化分析结果显示,LNSY-2017与主要的疫苗株同源性较低(91.4%~92.5%),而与2012年韩国毒株、美国2013年毒株以及中国近年来流行毒株同源性最高(97.0%~98.7%),属于基因G2b型.结果表明,沈阳地区的PEDV流行株已经发生很大变异,因此很有必要加强对PEDV变异的监测.
猪流行性腹泻病毒、S1基因、序列分析、遗传进化分析
S852.651(动物医学(兽医学))
2019-06-17(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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