牛源防御素类抗菌肽的生物信息学分析
为研究牛源防御素类抗菌肽的生物学功能,本研究利用ProtParam工具分析了抗菌肽的理化性质,利用SOPMA分析了抗菌肽的二级结构,利用NetOGlyc 4.0 Server分析了抗菌肽的糖基化,利用NetPhos 3.1 Server分析了抗菌肽的磷酸化,利用Target P 1.1 Server分析了抗菌肽的亚细胞内定位.结果表明,牛源防御素类抗菌肽为阳离子型抗菌肽,等电点在9.31～11.20之间;TAP、bBD-1、BNBD2、BNBD3、BNBD7、BNBD8和BNBD9为稳定性多肽,其他牛源防御素类抗菌肽为不稳定多肽;BNBD12和BNBD13为疏水性多肽,其他牛源防御素类抗菌肽为亲水性多肽;TAP、LAP、bBD-1、BNBD2、BNBD3、BNBD4、BNBD6、BNBD7、BNBD8和BNBD10由α螺旋、β折叠、β转角和无规则卷曲构成,EBD、BNBD1、BNBD5、BNBD11、BNBD12和BNBD13由β折叠、β转角和无规则卷曲构成;没有糖基化位点,除了BNBD7不存在磷酸化位点外,其他16种防御素类抗菌肽存在丝氨酸和苏氨酸的磷酸化位点,但不存在酪氨酸的磷酸化位点.根据分析结果推测牛源防御素类抗菌肽可作用于细胞壁或细胞膜,从而导致细菌死亡.
牛、防御素、抗菌肽、生物信息学
Q51(蛋白质)
国家自然科学基金项目31672559;河南省自然科学基金项目182300410031;河南省高校科技创新团队支持计划15IRTSTHN;河南科技学院高层次人才启动项目2014020
2018-09-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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