三个国外猪种线粒体COXⅠ基因SNPs筛选及序列分析

摘要：

本研究对三个国外猪种216个样本(大白猪、长白猪和杜洛克)mtDNA COXⅠ基因构建混合池,利用直接测序技术获得3个猪种COXⅠ基因的序列,进行SNPs筛选及序列分析,并采用MEGA 6.0分析软件基于Kimurk双参数模型应用邻接法构建系统发生树.结果表明,3个猪种mtDNA COXⅠ基因序列共存在16个突变位点,且有3个突变位点为3个猪种共有.长白猪与杜洛克猪的多态性较丰富,含有13个相同位点的突变,核苷酸的转换数(si)和颠换数(sv)的比值(R)分别为12和15,序列替换远未达到饱和.系统进化树和遗传距离分析显示长白猪及杜洛克亲缘关系较近,先聚为一支,再与大白猪、及野猪聚为一支.大白猪与中国东北地区野猪聚为一支,这可能与大白猪在培育过程中亲本遗传背景较复杂有关.本研究在一定程度上为了解大白猪的育成史及合理利用国外猪种提供了理论依据.

关键词：猪、线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基、遗传多态性

分类号：S828.2(家畜)

资助基金：西北民族大学国家级大学生创新创业训练计划项目201710742088

在线出版日期：2017-09-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：23-28