唾液酸转移酶ST6GALNAC1在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其预后和免疫学价值

摘要：

目的 本研究旨在利用生物信息学分析方法探讨ST6GALNAC1在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达及其预后和免疫学价值.方法 从TCGA数据库中获取HNSCC的转录组数据,使用R软件Limma包筛选糖基转移酶差异基因.通过UALCAN和HPA数据库对ST6GAL-NAC1进行表达分析.用UALCAN数据库分析ST6GALNAC1表达与不同临床特征的相关性.通过GEPIA2可视化网站进行生存分析.通过TIMER2.0数据库进行ST6GALNAC1表达与肿瘤相关成纤维细胞的相关性分析.使用R软件包IOBR计算免疫浸润细胞评分,用Sangerbox工具对免疫检查点基因和HLA基因的表达差异进行可视化.通过STRING、GEPIA2和Sangerbox工具进行ST6GALNAC1相关基因的富集分析.利用WB和q?PCR检测人舌鳞癌细胞系Cal27的ST6GAL?NAC1表达水平.结果 从TCGA数据库中筛选出HNSCC糖基转移酶差异基因ST6GALNAC1.在HNSCC中,ST6GALNAC1表达显著下调(P<0.05).ST6GALNAC1表达与HNSCC患者的肿瘤分级、年龄、淋巴结转移状况存在相关关系(P<0.05).ST6GALNAC1低表达组患者的总体生存期(OS)和无进展生存期(DFS)显著缩短(P<0.05).ST6GALNAC1表达与肿瘤组织的免疫细胞浸润、免疫检查点基因和HLA基因的表达呈负相关性.GO和KEGG分析显示ST6GALNAC1相关基因主要参与糖蛋白的生物合成过程.实验结果显示,Cal27细胞的ST6GALNAC1蛋白和mRNA表达水平下降.结论 ST6GALNAC1在HNSCC中表达下调,与HNSCC患者预后不良、肿瘤微环境免疫细胞浸润相关.ST6GALNAC1在Cal27细胞中表达下调.ST6GALNAC1有望成为新的HNSCC治疗靶点.

关键词：糖基转移酶、头颈部鳞状细胞癌、预后、免疫浸润、生物信息学

所属期刊栏目：23

分类号：R739.6(肿瘤学)

资助基金：中国博士后科学基金面上项目2022M713618

在线出版日期：2023-05-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：152-161