应用ABEEM方法计算含金属离子Ga3+蛋白的电荷分布

摘要：

首次开发ABEEM方法应用于含金属离子Ga3+蛋白体系的研究.ABEEM方法将分子电荷分解到了原子区域、σ键区域、π键区域和孤对电子区域.对金属离子Ga3+与蛋白之间的相互作用采用成键模型,Ga3+与配体原子之间有键电荷分布.通过蛋白晶体数据库的搜索,总结出Ga3+离子和蛋白相互作用的模型分子,确定了相关的新的电荷参数.应用ABEEM方法对模型分子的电荷分布、电荷转移和Ga3+离子的电荷进行了计算和分析.结果表明,ABEEM方法计算的电荷可以和从头算的HF/STO-3G方法的结果相比拟,可以快速给出所有的模型分子的电荷分布.并且通过金属离子Ga3+蛋白大分子体系的电荷计算验证了ABEEM方法以及电荷参数的正确性和可转移性.高价态的Ga3+离子和蛋白的相互作用的理论研究,为其动力学模拟研究奠定了基础.

关键词：ABEEM方法、Ga3+金属蛋白模型分子、Ga3+金属蛋白大分子体系、电荷分布、电荷转移

所属期刊栏目：44

分类号：O641(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目21473083;21133005

在线出版日期：2021-04-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：39-45