磷脂分子DPPC的浮动电荷分子力场

摘要：

基于量子化学(QM)计算和原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场(ABEEMσπ/MM),构建了1,2-二棕榈酰磷脂酰胆碱(1,2-dipalmitoyl-sn-phosphatidylcholine,DP-PC)分子的可极化势能函数.首先将DPPC分子分成乙基三甲基铵(ETMA)、乙酸甲酯(MAS)、磷酸二甲酯(DMP)和烷烃等官能团模型小分子片段,依据这些模型分子的QM结果,优选并确定相关电荷参数及力场参数.应用ABEEMσπ/MM对模型小分子的计算结果与QM计算结果符合很好,其中,稳定结构的键长、键角、二面角的绝对平均偏差(AAD)分别为0.0005nm、1.59°和1.33°,两者的电荷分布的线性相关系数为0.9688.进一步将上述函数应用到研究DPPC分子的结构和电荷分布,并与QM结果相比,结果表明:键长、键角、二面角的AAD和均方根偏差(RMSD)分别仅为0.00001和0.00002 nm、0.006°和0.009°、0.007°和0.011°;两者计算得到的电荷分布的线性相关系数为0.9659.

关键词：DPPC、ABEEMσπ/MM、可极化力场、浮动电荷模型、电荷分布

所属期刊栏目：41

分类号：O641.121(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目20703022;辽宁省自然科学基金资助项目20180550163;辽宁师范大学创新实践项目CX201801012

在线出版日期：2019-01-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：482-489