基于RNA-Seq技术的日本七鳃鳗(Lampetra japonica)肝脏转录组从头组装及分析
采用RN A-seq技术对日本七鳃鳗肝脏进行高通量转录组测序.经从头(de no-vo)组装,最终获得了47293个Unigenes,N50为1447 bp.通过与多个数据库的同源比对,65.04% 的Unigenes得到了功能注释.在KEGG 分析中,从肝脏转录组中挖掘鉴定到了众多参与固有免疫相关防御途径的Unigene,表明七鳃鳗的肝脏可能在抵御病原体侵袭的早期防御中发挥了重要作用.基于该转录组,全面认识了七鳃鳗补体与凝集级联系统的遗传构成,为深入探索它们的起源进化以及重要基因的功能适应性研究提供了依据.应用拼接的转录组,批量筛选了大量的SSR分子标记,为以后的遗传多样性研究和种质保护工作提供了候选材料.为今后深入认识七鳃鳗早期肝脏的免疫防御功能,探索该物种适应复杂水生生活的免疫进化以及群体多样性保护,奠定了重要的理论和实践基础.
日本七鳃鳗、转录组、肝脏、免疫防御、微卫星标记
41
Q291
国家自然科学基金资助项目31601044,31170353;国家重点基础研究发展计划973计划课题资助项目2013CB835304;全国海洋公益资助项目201305016;辽宁省教育厅重大科技平台项目L201683650;中国博士后科学基金第59批面上资助项目;大连市科学技术计划资助项目2013E11SF056;辽宁师范大学青年科研项目LS2015L009
2018-04-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共11页
68-78
