应用ABEEMσπ方法估算含有羟基的分子的pKa值
使用B3LYP/6-311++G(d,p)方法,优化获得含有羟基的训练集分子的稳定几何结构,以HF/STO-3G方法所计算的Mulliken电荷为基准,采用线性回归和最小二乘法调试出ABEEMσπ方法计算电荷所需要的参数(价态电负性x*和价态硬度η*).探讨拟合训练集分子中与羟基相连的C原子和与羟基的H原子的电荷差值与实验pKa值的线性方程.通过该线性方程和ABEEMσπ所计算的电荷,估算出一些含有羟基测试集分子的pKa值.这些分子包括了12个含有羟基的有机小分子;1个Tyr二肽、6个Ser二肽;质子化和中性的Trp-cage蛋白质.使用ABEEMσπ方法所估算的pKa值与实验值很接近.因此,ABEEMσπ方法能快速估算其他含有羟基分子的pKa值.
原子-键电负性均衡原理、电荷、pKa、二肽、Trp-cage蛋白质
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O641.121(物理化学(理论化学)、化学物理学)
国家自然科学基金资助项目21133005,21473083
2017-05-08(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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