基于Marching Cubes方法计算分子体积

摘要：

利用M arching Cubes方法，基于分子形貌理论，提出了分子等值面模型体积的计算公式。首先，利用二进制和十进制的转换关系定义体元顶点的标号，并将与分子表面相交的体元归纳为16种不同的构型，其中包括基本构型和特殊构型。然后针对不同构型给出相应的体积计算公式，最终通过求和得到整个分子的体积。该方法的优点在于不需要重建分子表面，即可通过已知网格数据和阈值直接得到分子的体积，易于理解，并具有较高的计算效率。最后，通过几个典型分子体积计算结果的对比，证实了该方法准确有效。此外，该方法同样适用于其他从规则网格数据中提取的等值面模型体积的计算。

关键词：Marching Cubes、分子形貌理论、分子体积、等值面

分类号：O641.121(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：国家自然科学基金项目21073080；21133005

在线出版日期：2014-07-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：198-203