应用ABEEM/MM模型研究异亮氨酸与水的氢键作用

摘要：

应用ABEEM/MM模型构建了异亮氨酸(Isoleucine)-水相互作用的势能函数,并将其运用到异亮氨酸与水组成的二聚体的研究中.在B3LYP/6-311++G(d,p)水平上,首先研究了异亮氨酸单体的几何构型,结果表明最稳定的构型是异亮氨酸的顺式结构,并用ABEEM/MM模型对其进行优化和电荷分布分析;其次研究了异亮氨酸与1个水的相互作用,通过分析氢键作用区域得到4种稳定构象,用ABEEM/MM和从头算方法计算稳定二聚体的结合能.数据表明,ABEEM/MM模型与从头算方法得到的结果有很好的一致性.

关键词：ABEEM/MM、异亮氨酸、氢键作用、从头算、结合能

所属期刊栏目：34

分类号：O641.121(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：国家自然科学基金项目20633050,20873055,20703022

在线出版日期：2011-06-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：54-58