七鳃鳗(Lampetra japonica)白细胞cDNA文库构建及生物信息学分析

摘要：

以复合免疫日本七鳃鳗(Lampetra japonica)外周血中分离的单个核白细胞为材料,构建库容量为4.5×106pfu·mL-1的cDNA文库,随机挑选单克隆菌落测序共得到10 500条有效ESTs(expressed sequence tags)序列.经PHRAP软件对序列拼接组装后得到3 382个转录本,其中有1 080个重叠群和2 302个单一序列,有59.08%的转本录在NCBI数据库中搜索到同源序列.运用Blast2GO软件进行Gene Ontology注释,分别有27.47%、25.20%和10.01%的转录本参与细胞生理、代谢和生物调节等生物学途径;分别有48.43%、22.10%和10.69%的转录本起到结合,催化和结构分子活性等分子功能.统计数据显示,与细胞自身基因转录、蛋白质合成及转运等生命过程密切相关的基因如真核转录延长因子、反转录酶、核糖体蛋白、腺苷酸转运体、细胞色素C氧化酶和热体克蛋白等在血液白细胞群中大量表达.另外,与固有免疫密切相关的白细胞衍生趋化因子、抵抗素、颗粒体蛋白等表达量相对较高,说明固有免疫系统在七鳃鳗感染初期的免疫防卫方面起着主要作用.

关键词：日本七鳃鳗、类淋巴细胞、EST、分子标识、发育分化

所属期刊栏目：33

分类号：Q811.4;Q959.392(生物工程学(生物技术))

资助基金：国家重点基础研究发展计划项目2007CB815802;国家高技术研究发展计划项目2007AA09Z400;国家自然科学基金项目30970342;教育部留学回国人员基金;辽宁省高校创新团队支持计划项且2006R32,2007T089,2008T103

在线出版日期：2010-07-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：237-243