甘氨酸-α-二肽构象稳定性的理论研究

摘要：

二肽分子CH3CO[NHCH2CO]NHCH3中的结构基元[NHCH2CO]是甘氨酸-α-多肽的基本重复单元.其中二面角ψ和ψ的不同取值决定了多肽的不同构象.使用B3LYP/6-311G(d,p)方法对二肽分子CH3CO[NHCH2CO]NHCH3的所有可能稳定构象进行了研究,分析了二肽分子CH3CO[NHCH2CO]NHCH3的不同稳定构象的相对稳定性,从分子内氢键作用、大基团间的空间位阻以及库仑作用角度探讨了影响二肽构象稳定性的因素.结果表明:甘氨酸-α-二肽中构象的相对稳定性主要取决于分子内氢键作用和ψ角的空间位阻.ψ角的空间位阻不起决定作用.因此在多肽分子的分子模拟中,如何准确合理地描述ψ角的空间位阻是今后分子模拟工作者要解决的重点课题.

关键词：二肽、α-多肽、重复单元、密度泛函理论

所属期刊栏目：27

分类号：O641.12+1(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：国家自然科学基金20173025;辽宁省教育厅资助项目202122026

在线出版日期：2004-06-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：41-44