多组学数据整合分析显示皮肤衰老过程中免疫微环境的改变特征

摘要：

目的 研究皮肤自然衰老过程中基因表达和免疫微环境的动态变化.方法 收集GTE x项目中699个皮肤组织转录组测序数据(RNA-seq),依据年龄段分为年轻组(20～39岁)和衰老组(60～79岁),进行差异基因表达分析.用CIBERSORT预测样本的免疫细胞浸润度,分析其随皮肤衰老的动态变化;用Seurat对已公开皮肤单细胞转录组数据(scRNA-seq)进行分析,观察免疫细胞群体随衰老的动态变化;比较年轻组和衰老组各细胞类群中免疫相关基因的动态表达变化.结果 对年轻组与衰老组进行差异表达分析显示,非暴露和暴露皮肤组织中转录表达水平发生了明显变化,衰老皮肤组织中转录上调的基因中显著富集炎症相关通路;多年龄段数据分析显示49个炎症水平相关基因的表达水平随皮肤衰老逐渐上调.免疫细胞浸润度预测分析显示年轻组与衰老组间无明显差异,但其在衰老皮肤组织中个体异质性大;对衰老和年轻皮肤组织的scRNA-seq进行分析,发现T细胞及其他免疫细胞亚群的大小随衰老逐渐下降,同时发现非免疫细胞中免疫相关基因随皮肤衰老表达上调.结论 皮肤衰老过程中基因转录表达和免疫微环境发生明显改变,炎症相关基因明显上调;T细胞类群数量明显减少,多种主要非免疫细胞类群表达炎症相关因子,表明非免疫细胞可能在皮肤衰老过程中发挥重要作用.

关键词：皮肤、衰老、单细胞、免疫微环境、转录组学

所属期刊栏目：29

分类号：R735.7;A81;TP311.13

资助基金：国家自然科学基金32070792

在线出版日期：2022-07-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：197-205