BRD9调控NLRP3炎性小体激活在急性肾损伤的作用和机制研究

摘要：

目的:探索急性肾损伤(AKI)发病过程中的关键基因和潜在治疗靶点.方法:从GEO数据库中下载AKI数据集GSE139061,通过edgeR包分析以确定正常人和AKI患者间的差异表达基因(DEGs),基于GO和KEEG富集分析研究DEGs功能.通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)和DEGs分析,结合随机森林算法筛选生物标志物.同时,单细胞测序数据集GSE139506,用于明确诊断标志物的动态变化及参与的生物学过程.以LPS诱导RAW264.7细胞构建巨噬细胞极化的细胞模型,给予BRD9选择性抑制剂GSK602(0.5μM)干预,检测p65、NLRP3、IL-1β、和IL-18的蛋白表达情况.结果:在正常人和AKI患者间识别出397个DEG,其中247个表达升高,150个表达降低.GO和KEGG分析表明,炎症信号在AKI中显著富集.结合WGCNA和DEGs分析筛选得到28个生物标志物,基于随机森林算法进一步筛选出核心基因BRD9.通过单细胞数据分析发现,在AKI发病过程中,巨噬细胞显著高表达BRD9,炎症信号和炎性小体活化相关通路也显著富集.细胞学实验表明,GSK602明显抑制p65蛋白的表达,以及NLRP3炎性小体的激活和抑制炎症因子IL-1β、IL-18的释放.结论:BRD9通过调节巨噬细胞NLRP3炎性小体的激活参与AKI发病过程,抑制BRD9有望成为AKI新的治疗方法.

关键词：急性肾损伤、共表达网络分析、随机森林、BRD9

所属期刊栏目：28

分类号：R735.7;R5;R373.2

资助基金：国家自然科学基金;广东省自然科学基金面上项目;广东省自然科学基金面上项目

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：137-141