顺铂诱导急性肾损伤差异基因的分析和鉴定

摘要：

目的:分析与鉴定顺铂诱导急性肾损伤(Cisplatin induced acute kidney injury,Cis-AKI)的关键差异基因.方法:选取公共基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中Cis-AKI大鼠的微阵列测序数据集进行分析,通过R软件中的limma包分析Cis-AKI的差异基因(Differentially expressed genes,DEGs),对差异基因进行基因的本体论(Gene Ontology,GO)分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析.使用MCODE模块和CytoHubba模块筛选蛋白质互作网络(Protein-Protein Interaction Networks,PPI)中的关键差异基因.结果:与对照组相比,Cis-AKI组共有119个DEGs,其中上调基因62个,下调基因57个.DEGs主要富集在细胞周期和昼夜节律等通路上.ARNTL、CLOCK、CRY1、DBP、PER3、NR1D1、CCNG1、FOS、BTG2和AEN基因被鉴定为是Cis-AKI中的关键差异基因.这些关键差异基因主要富集在p53信号通路、细胞周期和昼夜节律等相关通路.结论:利用生物信息学方法对Cis-AKI差异表达基因的分析,鉴定出ARNTL、CLOCK、CRY1、DBP、PER3、NR1D1、CCNG1、FOS、BTG2和AEN等基因是Cis-AKI中的关键差异基因.

关键词：顺铂、急性肾损伤、生物信息学、差异表达基因

所属期刊栏目：27

分类号：O627.41;S855.3;R361.3

在线出版日期：2022-05-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：123-128