关于识别60岁以下急性心肌梗死患者潜在致病基因的研究

摘要：

目的:应用生物信息学方法对GSE34198基因表达谱进行重新分析,挖掘年龄小于60岁的急性心肌梗死(AMI)患者潜在的致病和治疗基因.方法:根据GSE34198的临床资料,将患者分为年龄小于60岁的健康对照组(n=19)和急性心肌梗死组(AMI组,n=19).应用GEO2R鉴定差异表达基因(P<0.05和|logFC|>0).然后对其进行基因本体(GO)和通路富集分析(KEGG).用Cytoscape 3.6.1构建蛋白相互作用网络(protein-protein interaction,PPI),鉴定出10个核心基因.从在线孟德尔遗传数据库(OMIM)中手动筛选已知AMI易感基因和保护基因.通过检索互作基因(STRING)数据库,构建核心基因和已知AMI易感基因的PPI网络.结果:共筛选出1085个差异基因,其中上调基因570个,下调基因515个.构建蛋白互作网络后,鉴定出10个核心基因.其中,MAPK1、CKAP4、LAMC1、GRB2、DYNL1和KCTD6与已知易感基因有相互作用.结论:MAPK1是60岁以下急性心肌梗死潜在的诊断和治疗靶点,另外,CKAP4是一个潜在的诊断标志物,CRB2是一个潜在的药物治疗靶点.

关键词：急性心肌梗死、通路富集分析、蛋白相互作用网络分析、核心基因

所属期刊栏目：27

分类号：R542.2+2;R473.5;R654.2

资助基金：广东省自然科学基金2018A030313531

在线出版日期：2022-05-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：117-119,128