基于高通量测序的沼泽山雀简化基因组微卫星位点的开发

摘要：

沼泽山雀是一种广域分布物种,目前关于该物种的微卫星位点信息较少.高通量测序技术因其获得微卫星序列更加低廉、高效而逐渐被用于微卫星筛选当中.实验选取Illumina MiSeq高通量测序平台对沼泽山雀简化基因组进行了测序,共得到2.84M读长,共开发113 519个SLAF标签;利用MISA对所得的112 558条有效序列进行微卫星片段搜索,最终成功搜索出2 471个微卫星位点,总分布密度为870.07个/M.大量的微卫星位点为微卫星的进一步筛选提供了丰富的材料,有利于沼泽山雀后续遗传学水平方面的研究.

关键词：沼泽山雀、微卫星、高通量测序、简化基因组

所属期刊栏目：43

分类号：Q953+.5(动物学)

资助基金：国家自然科学基金项目31071927

在线出版日期：2016-10-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：252-257