10.16680/j.1671-3826.2018.12.02
miR-1254在结肠癌中调控差异表达基因及信号通路研究
目的 探讨miR-1254对结肠癌发生发展的影响及其在结肠癌中调控的差异表达基因(DEG)和信号通路.方法 在人结肠癌细胞系SW1116中瞬转miR-1254模拟体,通过高通量RNA测序分析(RNA-seq),筛选出受miR-1254调控的DEG,由生物信息学分析这些DEG所涉及的信号通路和蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络.结果 通过RNA-seq,筛选出了217条DEG.其中,121条下调基因,96条上调基因.这些基因主要富集在p53信号通路、氨酰-tRNA生物合成和内吞、甘氨酸/丝氨酸/苏氨酸代谢以及N-聚糖生物合成等信号通路中.PPI网络显示,结合蛋白较多的5个中心节点蛋白为UMPS、EGR1、CDKN1A、YARS以及ASNS.结论 miR-1254是一个多功能miRNA,在结肠癌发生发展中起重要作用.
miR-1254、结肠癌、高通量RNA测序分析
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R735.3(肿瘤学)
上海市卫计委面上项目201440426;上海市卫计委青年课题20154Y0160;上海市卫计委青年课题20174Y0084
2019-01-04(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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1398-1401