10.13213/j.cnki.jeom.2021.20337
二羟环氧苯并芘短期暴露对人支气管上皮细胞基因表达谱的影响
[背景]苯并[a]芘(BaP)可引起暴露人群呼吸系统损伤.既往研究表明,BaP及其活性代谢物染毒细胞24h,即可引发细胞能量代谢异常、氧化损伤,导致细胞生存率降低.[目的]观察BaP活性代谢物二羟环氧苯并芘(BPDE)短期暴露导致的入支气管上皮细胞(16HBE)基因表达谱的变化,为探讨BPDE急性毒性机制提供依据.[方法]选取人支气管上皮细胞(16HBE),分别用终浓度0.5、1.0、2.0、4.0umol-L-1的BPDE染毒,同时设溶剂对照组(加入等体积二甲基亚砜)和空白对照组(加入正常培养基),处理24h后,CCK8法检测细胞存活率.根据细胞存活率,挑选一个剂量染毒组和溶剂对照组利用BGISEQ平台进行转录组测序(RNA-Seq).使用R语言中的DEseq2包检测不同样本的差异表达基因,并用phyper函数对差异基因进行基因本体论(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析.[结果]随BPDE染毒剂量的增加,16HBE细胞存活率呈下降趋势(Z=-7.79,P趋势＜0.01);0.5、1.0、2.0、4.0nmol·L-1 BPDE染毒组细胞存活率分别为94.56％±1.74％、84.80％±3.19％、80.08％±1.72％、62.72％±1.95％,均明显低于溶剂对照组(98.61％±0.61％)和空白对照组(100.00％±0.00％) (P＜0.05).选取2.0 μmol·L-1 BPDE染毒组和溶剂对照组细胞进行测序,结果显示,以基因变化倍数的对数绝对值|log2FCI＞1,P＜0.05为筛选标准,暴露组共检测出191个2倍及以上差异表达的基因;其中上调的基因87个,下调的基因104个.基因共表达网络分析发现,趋化因子CXCL6、CXCL1、CXCL3、CXCL8和集落刺激因子CSF2具有较强的关联性.GO分析显示,差异表达基因主要参与细胞增殖的生物学过程,并通过KEGG通路分析发现,这些基因主要富集于白介素(IL) -17信号通路和炎症趋化因子等通路.进一步分析差异表达的mRNA,发现有670个mRNA表达上调,878个mRNA表达下调;差异表达mRNA主要富集于凋亡执行期负调控、细胞外信号转导负调控和信号受体活动的调节等生物学过程,主要影响铁死亡,调控干细胞多能性,赖氨酸退化等信号通路.[结论]BPDE短期暴露可引起16HBE细胞基因表达谱的改变,生物信息学分析结果提示IL-17信号通路和铁死亡途径可能参与该细胞损伤的过程.
二羟环氧苯并芘、苯并[0]芘、短期暴露、mRNA测序、生物信息学分析
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R114(卫生基础科学)
国家自然科学基金项目;山西省重点研发计划国际科技合作项目;山西省青年科技研究基金
2021-03-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
51-57,63
