肿瘤坏死因子受体超家族成员21在肝细胞癌中的表达及临床意义

摘要：

目的 基于生物信息学分析探讨肿瘤坏死因子受体超家族成员21(TNFRSF21)在肝细胞癌(HCC)中的表达和预后价值、潜在的生物学功能及对免疫微环境的影响.方法 从高通量基因表达(GEO)数据库获取HCC细胞株数据集筛选共交集基因.从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取HCC样本数据信息,分析TNFRSF21表达与总生存时间(OS)、临床病理特征的关系,以及在癌组织和癌旁组织中的表达情况.收集2009年7月至2010年10月手术切除的67例HCC组织及配对癌旁组织,采用实时荧光定量PCR(qPCR)检测TNFRSF21水平,分析HCC组织中TNFRSF21表达水平及与HCC患者OS的关系.通过STRING构建蛋白互作网络,采用基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,探讨TNFRSF21的生物学功能和肿瘤相关通路.使用TIMER和TISIDB数据库分析HCC中TNFRSF21表达与肿瘤免疫浸润细胞的相关性.结果 基于GEO数据集,筛选出CSN5基因敲低的HepG2、Huh7细胞株与COP1基因敲低的HepG2、Huh7细胞株共同的差异表达基因TNFRSF21、CROT、APPBP2和CPD.基于TCGA数据库,TNFRSF21在50例癌旁组织中的中位表达量为3.125,而在374例HCC组织中为3.953(P<0.001).HCC组织中TNFRSF21 mRNA的相对表达量为1.77±1.60,高于配对癌旁组织的1.07±0.83(P=0.002).生存分析显示,仅TNFRSF21基因表达与OS有关(P=0.030).67例HCC患者中,TNFRSF21低表达组的中位OS未达,显著优于高表达组的35.0个月(P=0.039).根据TCGA数据库TNFRSF21表达中位值2.678将374例HCC患者分为TNFRSF21高表达组和低表达组,发现TNFRSF21表达与血清AFP水平(P<0.001)和血管侵犯(P=0.029)有关.STRING及富集分析发现,TNFRSF21可能通过APP、TARDD等配体参与NF-κB及JNK信号通路调控肿瘤的发生发展.TIMER分析显示,TNFRSF21表达与B细胞(r=0.299,P<0.001)、CD8+T细胞(r=0.242,P<0.001)、CD4+T细胞(r=0.417,P<0.001)、巨噬细胞(r=0.527,P<0.001)、中性粒细胞(r=0.389,P<0.001)及树突细胞(r=0.363,P<0.001)免疫浸润呈正相关;TISIDB分析显示,TNFRSF21表达与活化的树突状细胞(r=0.271,P<0.001)、滤泡辅助性T细胞(r=0.333,P<0.001)、肥大细胞(r=0.270,P<0.001)和CD4+中央记忆性T细胞(r=0.393,P<0.001)丰度呈正相关.结论 TNFRSF21在HCC组织中表达升高,高表达者预后不良.TNFRSF21可能通过内皮细胞坏死和肿瘤免疫浸润细胞改变肿瘤微环境,促进HCC的发生发展,有望成为HCC预后不良的分子标记物.

关键词：肝细胞癌、肿瘤坏死因子受体超家族成员21、基因表达、肿瘤免疫浸润细胞、预后

所属期刊栏目：27

分类号：R735.7(肿瘤学)

在线出版日期：2022-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：201-209