基于生物信息学途径挖掘防治急性高原病的潜在药物

摘要：

目的 应用生物信息学途径挖掘潜在的防治急性高原病的药物.方法 选取急性高原低氧暴露7 d大鼠心肌组织标本,进行全转录组高通量测序,筛选差异表达mRNA.应用生物信息学工具Connectivity Map,整合差异表达mRNA信息,推测急性高原低氧心肌损伤差异基因与药物小分子功能的关系,筛选潜在的具有防治急性高原低氧心肌损伤效应的药物.结果 高通量测序结果显示,与常压常氧对照组比较,急性高原低氧暴露大鼠心肌组织中1084个mRNA表达水平发生显著变化.其中457个mRNA表达上调,627个mRNA表达下调.通过connectivity map药物数据库比对分析,发现小分子化合物SB203580负性富集分数较高,是潜在的防治急性高原病的药物.动物实验提示SB203580可减轻高原低氧大鼠心肌水肿和心肌组织病理损伤,下调心肌AQP1mRNA表达.结论 通过生物信息学方法可挖掘出潜在的防治急性高原病的药物,研究方法合理、简便、省时,减少了药物开发研究的盲目性.

关键词：高原病、低氧、计算生物学、药物评价、临床前、数据挖掘

所属期刊栏目：22

资助基金：全军后勤重点项目BBJ14 L001

在线出版日期：2019-07-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：503-507