基于生物信息学分析筛选卵巢癌预后相关的核心基因

摘要：

目的 运用生物信息学方法筛选与卵巢癌预后相关的核心基因.方法 对卵巢癌基因芯片数据集(GSE18520和GSE26712)进行差异分析,获得差异表达基因.应用Metas-cape 在线数据库对差异基因的功能和通路进行富集分析,使用MCC算法筛选通路中的潜在核心基因并构建蛋白互作网络,采用Kaplan-Meier Plotter数据库进行生存期分析.结果 差异分析显示,有540个基因在两个数据集中均存在差异表达.GO富集分析显示,差异基因在细胞外基质通路显著富集.基于蛋白互作网络和MCC算法获得10个在蛋白互作网络中发挥关键作用的核心基因,结合生存期分析筛选出5个与卵巢癌预后相关的基因.结论 筛选出的COI4A1、LAMB1、LAMA4、VCAN和COMP可作为卵巢癌预后相关的分子标志物.

关键词：卵巢肿瘤、生物信息学、核心基因、预后

所属期刊栏目：38

分类号：R737.31(肿瘤学)

在线出版日期：2023-02-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1249-1252