lncRNA HOXA-AS2在视网膜母细胞瘤中的预后价值

摘要：

目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)HOXA-AS2在视网膜母细胞瘤组织中的预后价值.方法 随机选取2018年5月就诊我科的3例视网膜母细胞瘤患儿的癌组织及同期就诊的3例正常视网膜样本,对两组间的组织样本进行lncRNA表达谱分析,筛选差异表达lncRNA.然后选择中挑选出HOXA-AS2,回顾性选取标本库中2012年1月至2017年12月就诊我科的60例视网膜母细胞瘤的手术标本进行PCR验证,根据HOXA-AS2表达水平进行分组,评估HOXA-AS2高表达组与HOXA-AS2低表达组的预后.最后预测HOXA-AS2的靶基因,并对靶基因数据集进行GO分析进行生物功能富集.结果 对3例视网膜母细胞瘤和3例正常对照组的视网膜组织的ln-cRNA表达谱进行比较分析,共筛选出141个差异lncRNA,其中上调lncRNA共110个,下调lncRNA共31个.选择差异倍数最大的HOXA-AS2(logFC 4.54,P=3.94E-07)进一步验证.进一步搜集于2012年1月至2017年12月就诊我科的60例视网膜母细胞瘤的手术标本进行qRT-PCR验证,年龄2.5±1.8(0.6-6)岁,以HOXA-AS2表达中位值为截点进行分组,结果 提示,HOXA-AS2高表达组的3年OS低于HOXA-AS2低表达组(51.2％比96.0％,P=0.006).HOXA-AS2表达与不同性别、组织分型、肿瘤分期和视神经侵犯无关,与浸润有关,HOXA-AS2高表达组的脉络膜浸润率高于HOXA-AS2低表达组(35.5％比10.3％,P=0.021).对视网膜母细胞瘤患儿的OS预后多因素分析,结果 提示,较高的HOXA-AS2表达水平(OR=2.632,95％CI:1.228-5.641,P=0.013)是视网膜母细胞瘤患者预后(OS)的独立危险因素.运用Multi Experiment Matrix(MEM)在线数据库进行HOXA-AS2的靶基因预测,对HOXA-AS2的靶基因数据集进行GO分析,生物信息学分析结果 提示主要富集于"早期胚胎发生后脑发育中前Hox基因的激活"的生物学过程中(FDR=5.60E-06).结论 视网膜母细胞瘤组织HOXA-AS2高表达可作为视网膜母细胞瘤不良预后的独立因素,有望成为视网膜母细胞瘤的预后标记物.

关键词：长链非编码RNAHOXA-AS2、视网膜母细胞瘤、预后标记物

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在线出版日期：2020-09-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：303-307