10.3969/j.issn.1004-2806-B.2010.05.001
血型A抗原模拟多肽与抗A抗体的分子对接
目的:从分子结构水平研究血型A抗原及其模拟多肽(肽P1 QIWYERTLPFTF,肽P2 EYWYCGMNRTGC)与血型A抗体的相互作用.方法:利用Chimera软件构建血型A抗原模拟多肽(P1,P2)的三维结构;将天然血型A抗原及其模拟多肽通过Autodock软件与血型A抗体Fv段(PDB:1jv5)对接.结果:天然血型A抗原和多肽P1、P2都能与1jv5分子中一个由疏水性氨基酸组成的凹槽对接,且对接部位重叠.天然A抗原和P1可以与1jv5形成2个氢键,且天然抗原和模拟多肽都能够与1jv5中的多个氨基酸相合作用.结论:通过生物信息学计算软件成功模拟了血型A抗原及其模拟多肽与抗体1jv5的相互作用情况.此2个模拟多肽是从功能上对天然A抗原进行模拟的.
分子对接、血型A抗原、血型A抗体
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R457.1(治疗学)
2011-03-11(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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