芯片技术研究lncRNA在非IgA系膜增生性肾小球肾炎中的表达

摘要：

目的 通过微阵列芯片技术研究非IgA系膜增生肾小球肾炎(non-IgA mesangial proliferative glomerulonephritis,non-IgA MsPGN)组(观察组)及对照组中信使RNA (Message RNA,mRNA)和长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)的差异性表达,从而探索lncRNA在non-IgA MsPGN发病机制中潜在的作用.方法 通过单纯随机抽样分别选取4例non-IgA MsPGN患者和2例未患肾病者作为观察组和对照组,分别收集2组的肾皮质组织,提取并鉴定总RNA,然后制备双链cDNA,单色荧光标记后用于芯片杂交.通过Gene Ontology,Pathway分析及mRNA与ln-cRNA基因座位置关联分析,找出与non-IgA MsPGN密切相关的lncRNA.最后,采用半定量逆转录聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)对部分基因的芯片检测结果进行检测,验证基因芯片结果的可靠性.结果 经过折叠倍率过滤(fold-change filtering),筛选出有统计学差异(P＜0.05)表达的mRNA转录本4 317个与lncRNA转录本3 502个.经分析,发现了5个在non-IgA MsPGN发病机制中有着重要潜在作用的lncRNA:AF1180924(相邻编码基因FGG),AK092233(相邻编码基因COL18A1),AK130579(相邻编码基因CREBBP),AK023598(相邻编码基因LEPR),AK055915(相邻编码基因CDC42EP3),为全面揭示non-IgA MsPGN发病机制提供了重要依据.结论 某些lneRNA可潜在调控相关基因,在non-IgA MsPGN的发病机制及发展过程中起重要作用.

关键词：长链非编码RNA、非IgA系膜增生肾小球肾炎、差异性表达、微阵列芯片

所属期刊栏目：15

分类号：R72;R73

资助基金：广西自然科学基金2011GXNSFB018105

在线出版日期：2015-07-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：234-238