综合生物信息学对胶质瘤替莫唑胺耐药的中枢基因的鉴定研究

摘要：

目的 通过综合生物信息学方法分析并鉴定出胶质瘤替莫唑胺耐药的中枢基因,为胶质瘤耐药机制研究和临床治疗提供新的方向.方法 R语言筛选差异表达基因(DEGs);基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析其功能及通路;蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析筛选DEGs的中枢基因(hub genes);Gliovis数据库验证原发与复发胶质瘤组织中hub genes的mRNA表达及对其进行生存分析.结果 共筛选1 230个DEGs,其中648个上调基因及582个下调基因.GO显示DEGs在生物过程(BP)上参与核糖体的生物发生、核糖核蛋白复合体生物合成、rRNA加工等;细胞组分(CC)包括线粒体基质、浓缩染色体、染色体区域等;在分子功能(MF)上参与催化活性,作用于RNA、转移酶活性等.KEGG显示DEGs主要参与核质转运、细胞周期、DNA复制等.PPI筛选出TOP10中枢基因:BUB1B、ASPM、KIF4A、CDC6、NCAPG、MCM7、MCM3、MCM5、MCM10、RFC4;Gliovis 数据库分析显示 BUB1B、ASPM、KIF4A、CDC6、NCAPG、MCM3、MCM5、MCM10、RFC4在复发胶质瘤组织中表达相对上调而且与生存期呈负相关.结论 通过综合生物信息学分析并鉴定出在耐药胶质瘤细胞和复发胶质瘤组织中高表达且与生存期呈负相关的BUB1B、ASPM、KIF4A、CDC6、NCAPG、MCM3、MCM5、MCM10、RFC4作为胶质瘤替莫唑胺耐药的中枢基因.

关键词：胶质瘤、替莫唑胺、耐药、生物信息学、中枢基因

所属期刊栏目：20

分类号：R739.41(肿瘤学)

资助基金：江苏省十四五医学重点学科基金项目;江苏省自然科学基金面上项目

在线出版日期：2023-11-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：536-541,548