CHPF2在胶质瘤中的表达及预后意义

摘要：

目的 采用生物信息技术分析软骨素聚合因子2(CHPF2)在胶质瘤中的预后意义,并通过实验进一步验证其在正常和胶质瘤细胞中的表达情况.方法 首先在GEPIA和HPA数据库对CHPF2在胶质瘤和正常细胞的表达水平进行分析,随后在癌症基因组图谱(TCGA)和中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)下载基因表达和临床信息文件对CHPF2在胶质瘤中的表达、预后、功能注释、免疫浸润和免疫检查点等情况作进一步阐明.最后采用蛋白质印迹(Western Blot,WB)技术分析了 CHPF2在正常和胶质瘤组织中的表达水平.结果 CHPF2在胶质瘤中的表达量高于正常组织,且随着肿瘤等级的升高而增加.除性别、放疗和肿瘤再发情况外,年龄、化疗、肿瘤复发、IDH、1p/19q及MGMT等在CHPF2高低表达组中均具有统计学差异.CHPF2较一些常见预后标志物(如TP53、MKI67及EGFR等)对胶质瘤患者生存具有更好的预测性能,可以作为一个独立的预后因素,并通过对TCGA和CGGA数据库的独立预后分析结果进行综合的Meta分析作进一步验证.通过GO、KEGG和GSEA方法,对CHPF2可能富集到的通路进行研究.采用TIMER、CIBERSORT和ssGSEA三种方法,对CHPF2高低风险组中的免疫浸润情况进行分析,并在最后对CHPF2在免疫检查点的情况进行了分析.为了进一步验证可靠性,本研究通过WB技术证实了 CHPF2在胶质瘤细胞的表达量较正常细胞中高.结论 CHPF2能够影响胶质瘤的发生、发展和预后,可以作为胶质瘤患者预后的生物标志物.

关键词：胶质瘤、CHPF2、生物信息学、免疫、预后

所属期刊栏目：20

分类号：R739.41(肿瘤学)

资助基金：淮安市自然科学研究计划项目HAB202118

在线出版日期：2023-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：163-172